Forskare inom CSN-proteinkomplexet

Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi

Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi är en del av Umeå Plant Science Centre (UPSC, https://www.upsc.se/) som är ett kompetenscentrum för experimentell växtforskning och skogsbioteknik i norra Sverige. UPSC vill göra excellent och innovativ grundforskning och skapa kunskap till nytta för skogsbruk, jordbruk, miljö och samhälle. Vi studerar växter från cellnivå upp till till ekofysiologi, samt från grundforskning till industriella tillämpningar. Vi försöker att förstå växters förmåga att växa, anpassa sig och acklimatisera sig till en föränderlig värld, kunskaper som kan leda till bättre växtsorter, odlingspraxis eller industriprocesser.

Nu söker vi en forskare till kartlägga strukturen hos CSN-proteinkomplexet i Arabidopsis.

Om jobbet

Projektet fokuserar på att studera vilken roll som subenheterna CSN5A och CSN5B i COP9-signalosomen (CSN-komplexet) har när det gäller att kontrollera utvecklingen av adventivrötter. CSN är ett evolutionärt bevarat multiproteinkomplex som reglerar proteinnedbrytning. Komplexet består av åtta underenheter, CSN1-CSN8. CSN5-subenheten uppvisar katalytisk aktivitet, det vill säga specifik deneddylering av CULLIN-subenheterna. Vissa växtarter har duplicerat CSN5- (CSN5A; CSN5B) och CSN6- (CSN6A; CSN6B) subenheterna, vilket leder till förekomsten av 4 olika multiproteinkomplextyper. Projektets mål är att analysera strukturen hos de olika komplexen, vilket bör bidra till att förstå deras respektive funktion. De olika komplexen kommer att renas från jäst som uttrycker märkta versioner av subenheterna eller från dubbelmutanter av Arabidopsis där endast ett av de fyra komplexen förekommer. Strukturanalysen kommer att genomföras i samarbete med CryoEM-anläggningen.

Som forskare kommer du att arbeta med att rena de olika CSN-komplexen från jäst och dubbelmutanter och analysera deras struktur med hjälp av kryoelektronmikroskopi-teknik. Du kommer också att på strukturell nivå analysera interaktioner med CUL-proteiner.

Utöver detta kommer också fenotypen för de multipla mutanterna att karakteriseras och analyseras i relation till CSN-komplexets strukturer.

Din bakgrund 

Doktorsexamen inom mikrobiologi, proteinbiokemi, molekylärbiologi eller motsvarande är ett krav. Färdigheter i vegetativ förökning och erfarenhet av att ha karaktäriserat Arabidopsis-mutanter, som förändrats i utvecklingen av adventivrötter, är ett krav och du måste också kunna genotypa, amplifiera och fenotypa dem. Ytterligare krav är erfarenhet av gensekvensanalys i synnerhet krävs erfarenhet av kloning av gener i olika uttryckssystem (jäst-, bakterie- och/eller insektsceller), rening av proteiner och kristallering av både enskilda subenheter och hela komplex in vitro.

Du måste ha god kännedom om stora proteinkomplex såsom CSN och behärska tekniker för rening från växter. Målet är att analysera strukturen hos ett stort proteinkomplex och koppla den till dess funktion. Därför måste kandidaten även vara utbildad i att förbereda prover för strukturell karakterisering av proteinkomplex med kryo-elektronmikroskopi (cryo-EM).

Om oss

UPSC består av två institutioner som tillhör två universitet, Umeå universitet (https://www.umu.se/) och Sveriges lantbruksuniversitet (SLU; https://www.slu.se/). Här arbetar cirka 200 personer av mer än 40 olika nationaliteter. Hos oss finns ett 30-tal gruppledare och våra forskare har tillgång till toppmoderna analysplattformar, unika resurser för t ex trädgenomik och växtodlingsanläggningar. Vi strävar efter att skapa en arbetsmiljö som främjar samarbete och stöttar våra forskare genom hela karriären, bland annat genom utbildning och individuell karriärvägledning.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba vid SLU på https://www.slu.se/om-slu/jobba-pa-slu/

Placering:

Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi, SLU, Umeå. 

Anställningsform:

Tidsbegränsad anställning 6 månader.

Omfattning:

100%

Tillträde:

Enligt överenskommelse.

Ansökan:

Välkommen med din ansökan via ansökningsknappen nedan senast 2026-07-16.

Fackliga kontaktpersoner:

https://internt.slu.se/min-anstallning/facket/kontaktpersoner/

 

Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) har en nyckelroll i utvecklingen för hållbart liv, grundad i vetenskap och utbildning. Genom vårt fokus på samspelen mellan människa, djur och ekosystem och ett ansvarsfullt brukande av naturresurserna bidrar vi till en hållbar samhällsutveckling och goda livsvillkor på vår planet. Huvudorter är Alnarp, Umeå och Uppsala, men verksamhet bedrivs också på forskningsstationer, försöksparker och utbildningsorter i hela landet. SLU har drygt 4000 medarbetare, 6000 studenter och forskarstuderande och en omsättning på över 4,5 miljarder kronor. Universitetet satsar på attraktiva miljöer på sina campusområden. Vi arbetar för en jämställd och inkluderande arbetsmiljö där öppna samtal mellan människor med olika erfarenheter lägger grunden för vetenskaplighet, kreativitet och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och perspektiv att söka den aktuella anställningen.